Το παλιό κτίριο του 5ου Γυμνασίου βρισκόταν επί της Στράβωνος και ήταν γνωστό ως “Οικονομικό Γυμνάσιο”.

Το καινούριο κτίριο χτίστηκε το έτος 1998-1999 και βρίσκεται στην οδό Γούναρη αριθμό 18. Αποτελείται από υπόγειο, ισόγειο και έναν όροφο. Διαθέτει ασανσέρ και ράμπες για εύκολη πρόσβαση σε όλους του χώρους του σχολείου. Επιπλέον διαθέτει μεγάλο προαύλιο χώρο με γήπεδο μπάσκετ και βόλεϋ.  Επίσης διαθέτει:

α) εργαστήριο Χημείας/Φυσικής

β) εργαστήριο Πληροφορικής

γ) εργαστήριο Τεχνολογίας

δ) αίθουσα Εκδηλώσεων

ε) 14 αίθουσες διδασκαλίας και

στ) 2 γραφεία καθηγητών, γραμματεία και γραφείο Δ/ντη.